رودخانه های تاجیکستان جاری بوده و عمدتاً به حوضه دریای آرال تعلق دارند. و فقط تعداد کمی از آنها به آبهای دریاچه کاراکول یا رودخانه تاریما سرازیر می شوند.
رودخانه آمو دریا
کانال دریای آمو از قلمرو چهار کشور به طور همزمان عبور می کند - افغانستان ، تاجیکستان ، ازبکستان و ترکمنستان. طول کل کانال 2400 کیلومتر است. از این تعداد ، 1415 کیلومتر از کشور می گذرد. منبع آمو دریا از تلاقی دو رود - وخش و پیانج تشکیل شده است. دهانه رودخانه آبهای دریای آرال است (در محل تلاقی یک دلتای بزرگ را تشکیل می دهد).
شاخه های کمی در نزدیکی رودخانه وجود دارد. به طور متوسط ، آمو دریا آبهای کافیرنیگان ، سرخانداریا و شیر آباد و همچنین یک شاخه فرعی چپ - رودخانه قندوز را دریافت می کند. و بعلاوه ، تا محل تلاقی ، دیگر شاخه ای وجود ندارد. از آبهای رودخانه به طور فعال استفاده می شود و بنابراین آمو دریا به دریای آرال نمی رسد. این دقیقاً همان چیزی است که یکی از دلایل خشک شدن آن شد.
در آبهای آمو دریا ، انواع مختلفی از ماهی وجود دارد: asp؛ مرد طاس ؛ گربه ماهی محلی ؛ سنجد؛ ماهی خرچنگ؛ کپور نقره ای ؛ آمور سفید ؛ نفرت.
رودخانه ونج
یکی از رودهایی که کانال آن منحصراً در قلمرو تاجیکستان واقع شده است. این سرشاخه راست رودخانه پیانج است. طول کل رودخانه 103 کیلومتر است. این منبع از تلاقی دو رودخانه تشکیل شده است - یکی از یخچالهای خط الراس وانچ ، دیگری از خط الراس آکادمی علوم (شیب غربی) فرود می آید. این کانال بین خط الراس وانچ و درواز قرار دارد.
رودخانه کشکادریا
از نظر سرزمینی ، بستر رودخانه از سرزمین های تاجیکستان (منطقه سغد) و ازبکستان (منطقه کشکادریا) می گذرد. به طور معمول ، رودخانه دارای سه نام است: در قسمت بالایی - اوبیخوندا ؛ دوره میانی - Shinachasai ؛ پایین - Maimanakadarya.
طول کل کانال 378 کیلومتر است. سرچشمه رودخانه در ارتفاع 2960 متری از سطح دریا قرار دارد و توسط دو رودخانه بی نام تشکیل شده است. شاخه های اصلی: Akdarya (Aksu) ؛ Tanhidizadarya؛ گوزرداریا
رودخانه موکسو
طول کل کانال 88 کیلومتر است. موکسو در منطقه جرگاتال تاجیکستان واقع شده است. منبع محل تلاقی دو رودخانه است: سلدارا و ساوکسوی (یخچال های فدچنکو و بولشوی ساوکدار).
رودخانه کوزیلسو
Kyzylsu ، که به معنی "رودخانه قرمز" است ، در قلمرو قرقیزستان و تاجیکستان جریان دارد. منبع آن دامنه های رشته ترانس آلایی است. طول کل کانال 235 کیلومتر است. در محل تلاقی رودخانه موکسو ، رودخانه وخش پدید می آید.
رودخانه وخش
طول کل کانال رودخانه 786 کیلومتر است و همه آنها از خاک تاجیکستان عبور می کنند. منبع رودخانه در دامنه های پامیر است ، اما محل تلاقی آن با آبهای رودخانه پیانج ، آمو دریا بزرگ را پدید می آورد. این رودخانه منبع اصلی آبیاری و همچنین تولید برق است.